Imaging
“A picture is worth 1000 words”
Confusius
“A picture is worth 1000 datas
the CHICS
Présentation
Le plateau d’imagerie propose une infrastructure et une expertise de pointe pour répondre à vos besoins en microscopie. Nous offrons une gamme de microscopes allant du conventionnel à la microscopie confocale.
Nous proposons des services de scan de lames, des formations à l’utilisation autonome des équipements ainsi qu’à l’analyse des images. Nous favorisons également les collaborations étroites pour des analyses approfondies ou le développement d’analyses par intelligence artificielle.
Services
Le plateau d’imagerie propose :
- Conseils afin d’optimiser la qualité des images de vos marquages.
- Assistance et formation à l’utilisation des instruments.
- Prestations de scan de lames.
- Analyses et formation à l’analyse des images.
- Collaborations.
Equipements
Zeiss – AxioObserver.Z1
Microscope à champs large : champ clair, lumière polarisée et fluorescence
Fluorescence : 4 paramètres
DAPI*(Ex=365nm; Em=445nm)
FITC* (Ex=470nm; Em=525nm)
TRITC* (Ex=545nm; Em=605nm)
Cy5* (Ex=640nm; Em=690nm)
*ou Fluorochromes compatibles
Leica Stellaris 5
Confocal Laser scanning microscope
Imagerie 3D : échantillons jusqu’à 100 µm
Excitations : 405nm, 448nm, white laser from 485nm to780 nm
5 détecteurs avec bandes spectrales ajustables
Imagerie facile de 5 fluorochromes (>10 possibles).
Objectifs disponibles : 4x, 10x, 20x, 40x, 63x.
Exemples de fluorochromes compatibles :
- DAPI + Alexa 488, 594, 647, 750
- DAPI,+ Opal 520, 620, 690, 780
- Presque tous les fluorochromes peuvent être utilisés, cependant les combinaisons doivent être choisies avec soin.
Scanner Zeiss – AxioScan.Z1
Scanner de lames – Capacité 100 lames – Champ clair et fluorescence
Fluorescence: 5 paramètres
DAPI* (Ex=365nm; Em=445nm)
FITC* (Ex=470nm; Em=525nm)
TRITC* (Ex=545nm; Em=605nm)
Cy5* (Ex=640nm; Em=690nm)
Cy7* (Ex=735nm; Em=809nm)
*ou Fluorochromes compatibles
Scanner spectral Akoya – PhenoImager HT
Capacité 80 lames – Champ clair et fluorescence
Demixing et prise en charge de l’autofluorescence du tissu
Fluorescence: 7 paramètres
DAPI* (Ex=391nm; Em=453nm)
Opal480* (Ex=524nm; Em= 478nm)
Opal520* (Ex=486nm; Em=532nm)
Opal570* (Ex=538nm; Em=571nm)
Opal620* (Ex=590nm; Em=633nm)
Opal690* (Ex=699nm; Em=709nm)
Opal780* (Ex=735nm; Em=832nm)
*ou Fluorochromes compatibles
Logiciels
Logiciel avancé d’analyse d’image (qualitatives, quantitatives, supervisée et non supervisée, segmentation des cellules, etc…) offrant une automatisation pour la quantification des données.
Disponible sur un poste informatique au CHICS – Formation gratuite
ZEN est l’interface utilisateur universelle qui équipe tous les systèmes d’imagerie de ZEISS pour capturer et traiter les images.
QuPath est un logiciel open-source d’analyse d’images permettant la détection, la segmentation et la quantification des cellules et des tissus dans des images histologiques.
Formation gratuite
TARIFS
