Cordeliers Genotyping & biochemistry (CGB)

La plateforme dispose du Système automatisé de Simple Western^TM de Protein Simple JESS. C’est une technologie innovante de     Bio-Techne, qui effectue des immuno-essais capillaires et des analyses Western blot entièrement automatisées, éliminant la complexité des immuno-essais traditionnels comme le Western blot et l’ELISA. Cette technologie permet de réaliser des Western blot plus rapidement entre 3 à 5h en fonction de la méthode choisie, d’utiliser entre 3µl d’échantillons dilués.

Trois matrices de séparation existent: 2-40 kDa, 12-230 kDa et 66-440kDa.

Différents modules de détection permettent une détection par la HRP, le proche infrarouge (NIR) ou encore l’infrarouge (IR) dans le même capillaire. Des modules de détection des protéines totales permettent de normaliser vos résultats à la quantité de protéines dans les échantillons . Vous pouvez faire du multimeplexing  et du Replex . Les dosages RePlex™ sont similaires au stripping et au repobing pour un Western blot, mais sans perte d’échantillon. Le Jess permet une multitude d’applications possibles allant du western classique à l’analyse de la pureté de préparation à usage thérapeutique .

La plateforme dispose du Système automatisé de Crystal Digital PCR™ « Naica R system 6-color dPCR » qui met de quantifier de façon absolue plusieurs cibles génétiques en une seule exécution.  Le système naica® est une plateforme dPCR simple d’utilisation qui exploite une technologie microfluidique de pointe pour intégrer le flux de travail dPCR sur une seule puce consommable. Les échantillons  sont divisés en un large éventail de milliers de cristaux de gouttelettes individuels, chacun possédant son propre compartiment de réaction, avant l’amplification des molécules d’acide nucléique dans chaque cristal de gouttelette. Ces réactions sont marquées avec des fluorophores pour être lues à l’aide de six canaux de lumière fluorescente différents.

Cela permet un flux de travail rapide et simple qui offre une capacité de multiplexage élevée avec une sensibilité puissante tout en réduisant le temps d’obtention des résultats et en économisant un échantillon précieux.

La PCR numérique a prouvé son adaptabilité dans de nombreux tests moléculaires et est désormais reconnue comme une méthode fiable non seulement pour la détection d’allèles rares et de mutations rares, mais également pour le génotypage, la quantification absolue et la variation du nombre de copies.

Le système naica® a été mis en œuvre avec succès dans une grande variété d’applications :  Cancer et biopsie liquide, Thérapie cellulaire et génique, Détection des maladies infectieuses, OGM et tests environnementaux.

Le système de PCR numérique à gouttelettes QX200 consiste à diviser l’échantillon en 20 000 gouttelettes de la taille d’un nanolitre. Chaque gouttelette agit comme une réaction PCR individuelle. Après l’amplification par PCR, les gouttelettes sont analysées pour déterminer la fluorescence afin de déterminer la présence de l’ADN cible permettant une quantification absolue basée sur le nombre de gouttelettes positives.

Le partitionnement des gouttelettes par la technologie QX200 Droplet Digital réduit les biais dus à l’efficacité de l’amplification et aux inhibiteurs de PCR.

Le Varioskan LUX  de chez Thermo Scientific est un lecteur de microplaques multimode qui combine simplicité et performances haut de gamme pouvant lire  :

§des Absorbances de 200 à 1000 nm

§des Intensités de Fluorescence allant de 270 à 870 nm (longueur d’onde d’émission).

§de l’Intensité de Fluorescence en temps résolu de 400 à 700 nm

§de la Luminescence de 360 à 670 nm

§de l’Aplha de 400 à 660 nm

Cet appareil est équipé d’un incubateur/agitateur

Le système 4200 TapeStation est une plate-forme d’électrophorèse automatisée à haut débit éprouvée pour le contrôle de la qualité des échantillons d’acide nucléique. Il permet une analyse entièrement automatisée, facile et fiable des échantillons d’ADN et d’ARN jusqu’à 96 échantillons par cycle. Le système 4200 TapeStation offre une solution complète pour un véritable contrôle de la qualité des échantillons de bout en bout dans les flux de travail de séquençage de nouvelle génération (NGS), de biobanque ou de développement de vaccins.