Génomique fonctionnelle des tumeurs solides (FUNGEST)

Responsable d'équipe :

Jessica Zucman-Rossi

Adjoint.e :

Didier Jean

Nous développons des approches génomiques translationnelles basées sur des analyses de tumeurs humaines afin d’identifier de nouveaux mécanismes de tumorigenèse (par exemple, de nouvelles altérations génomiques, des facteurs de risque cliniques/génomiques) et de proposer des biomarqueurs et des cibles thérapeutiques qui pourraient être introduits dans la pratique clinique. Notre stratégie générale est basée sur l’analyse génomique à grande échelle de larges cohortes de patients atteints de tumeurs hépatiques (bénignes et malignes), de mésothéliome et de cancer du rein. L’équipe est organisée en 5 groupes avec leurs projets :

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Thèmes scientifiques

Génomique des tumeurs hépatiques

Axé sur la caractérisation et la validation fonctionnelle des altérations génomiques dans les tumeurs hépatiques bénignes et malignes, l'identification de nouveaux facteurs de risque cliniques/génomiques avec comme objectif la transposition en clinique.

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Génomique des tumeurs hépatiques pédiatriques

Développe des stratégies innovantes pour l'analyse intégrative des données génomiques afin de déchiffrer l'interaction entre les facteurs de risque cliniques, les processus cellulaires endogènes et les altérations génomiques dans la carcinogenèse du foie.

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Cibles thérapeutiques dans les tumeurs du foie

Développe une approche intégrée allant de l'étude des bases moléculaires de l'initiation et de la progression des tumeurs aux applications des traitements ciblés et à l'identification de biomarqueurs prédictifs de la réponse thérapeutique.

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Mésothéliome

Étude de la pathogenèse du mésothéliome pleural malin (MPM), une tumeur rare dont le pronostic est défavorable en raison de l'absence de traitement efficace.

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Tumeurs HPV

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Principales publications

RSK2 inactivation cooperates with AXIN1 inactivation or ß-catenin activation to promote hepatocarcinogenesis. Samantha Schaeffer, Barkha Gupta, Anna-Line Calatayud, Julien Calderaro, Stefano Caruso, Théo Z Hirsch, Laura Pelletier, Jessica Zucman-Rossi, Sandra Rebouissou. Journal of hepatology 2023 link

Common genetic variation in alcohol-related hepatocellular carcinoma: a case-control genome-wide association study. Eric Trépo, Stefano Caruso, Jie Yang, Sandrine Imbeaud, Gabrielle Couchy, Quentin Bayard, Eric Letouzé, Nathalie Ganne-Carrié, Christophe Moreno, Abderrahim Oussalah, Cyrille Féray, Jean Frédéric Blanc, Bruno Clément, Patrick Hillon, Jérôme Boursier, Valérie Paradis, Julien Calderaro, Viviane Gnemmi, Jean-Charles Nault, Jean-Louis Guéant, Jacques Devière, Isabelle Archambeaud, Carole Vitellius, Bruno Turlin, Jean-Pierre Bronowicki, Thierry Gustot, Angela Sutton; GENTHEP Consortium; Marianne Ziol , Pierre Nahon , Jessica Zucman-Rossi. The Lancet Oncology 2022 link

Hepatitis B virus integrations promote local and distant oncogenic driver alterations in hepatocellular carcinoma. Camille Péneau, Sandrine Imbeaud, Tiziana La Bella, Theo Z Hirsch, Stefano Caruso, Julien Calderaro, Valerie Paradis, Jean-Frederic Blanc, Eric Letouzé, Jean-Charles Nault, Giuliana Amaddeo, Jessica Zucman-Rossi. Gut 2022. link

Telomere length is key to hepatocellular carcinoma diversity and telomerase addiction is an actionable therapeutic target. Massih Ningarhari, Stefano Caruso, Théo Z Hirsch, Quentin Bayard, Andrea Franconi, Anne-Laure Védie, Bénédicte Noblet, Jean-Frédéric Blanc, Giuliana Amaddeo, Nathalie Ganne, Marianne Ziol, Valérie Paradis, Catherine Guettier, Julien Calderaro, Guillaume Morcrette, Youngsoo Kim, A Robert MacLeod, Jean-Charles Nault, Sandra Rebouissou, Jessica Zucman-Rossi. Journal of hepatology 2021 link

Integrated Genomic Analysis Identifies Driver Genes and Cisplatin-Resistant Progenitor Phenotype in Pediatric Liver Cancer. Theo Z Hirsch, Jill Pilet, Guillaume Morcrette, Amélie Roehrig, Benedict J E Monteiro, Laura Molina, Quentin Bayard, Eric Trépo, Léa Meunier, Stefano Caruso, Victor Renault, Jean-François Deleuze, Brice Fresneau, Christophe Chardot, Emmanuel Gonzales, Emmanuel Jacquemin, Florent Guerin, Monique Fabre, Isabelle Aerts, Sophie Taque, Véronique Laithier, Sophie Branchereau, Catherine Guettier, Laurence Brugières, Sandra Rebouissou, Eric Letouzé, Jessica Zucman-Rossi. Cancer discovery 2021 link

DNA Methylation Signatures Reveal the Diversity of Processes Remodeling Hepatocellular Carcinoma Methylomes. Léa Meunier, Théo Z Hirsch, Stefano Caruso, Sandrine Imbeaud, Quentin Bayard, Amélie Roehrig, Gabrielle Couchy, Jean-Charles Nault, Josep M Llovet, Jean-Frédéric Blanc, Julien Calderaro, Jessica Zucman-Rossi, Eric Letouzé. Hepatology 2021 link

Adeno-associated virus in the liver: natural history and consequences in tumour development. Tiziana La Bella, Sandrine Imbeaud, Camille Peneau, Iadh Mami, Shalini Datta, Quentin Bayard, Stefano Caruso, Theo Z Hirsch, Julien Calderaro, Guillaume Morcrette, Catherine Guettier, Valerie Paradis, Giuliana Amaddeo, Alexis Laurent, Laurent Possenti, Laurence Chiche, Paulette Bioulac-Sage, Jean-Frederic Blanc, Eric Letouze, Jean-Charles Nault, Jessica Zucman-Rossi. Gut 2020 link

Clinical Impact of Genomic Diversity From Early to Advanced Hepatocellular Carcinoma. Jean-Charles Nault, Yoann Martin, Stefano Caruso, Théo Z Hirsch, Quentin Bayard, Julien Calderaro, Cecile Charpy, Christiane Copie-Bergman, Marianne Ziol, Paulette Bioulac-Sage, Gabrielle Couchy, Jean-Frédéric Blanc, Pierre Nahon, Giuliana Amaddeo, Nathalie Ganne-Carrie, Guillaume Morcrette, Laurence Chiche, Christophe Duvoux, Sandrine Faivre, Alexis Laurent, Sandrine Imbeaud, Sandra Rebouissou, Josep M Llovet, Olivier Seror, Eric Letouzé, Jessica Zucman-Rossi. Hepatology 2020 link

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