Plateau de Spatial-omics
Perdu dans le dédale des nouvelles technologies de spatial-Omics ?
Nous sommes là pour vous guider à travers ce labyrinthe de nouvelles possibilités
PRESENTATION
Sur le plateau de Spatial-omics nous mettons à disposition nos équipements et notre expertise pour vos expériences de transcriptomique et protéomique spatiale .
La transcriptomique spatiale permet d’étudier l’expression des gènes in situ sur des coupes histologiques. Elle permet de donner une image de l’activité transcriptionnelle sur un échantillon tissulaire, afin de mieux comprendre par exemple, comment les cellules interagissent et se spécialisent en fonction de leur environnement.
La protéomique spatiale permet de mesurer l’expression de plusieurs dizaines à plusieurs centaines de protéines simultanément sur une coupe histologique.
Contactez nous pour discuter de tous les aspects de votre prochain projet spatial, de sa faisabilité à son exécution.
SERVICES
- Explications et conseils pour choisir la meilleure approche technologique.
- Assistance et formation à l’utilisation des instruments.
- Réalisation de l’expérience dans son intégralité (à l’exclusion du séquençage).
- Analyse préliminaire et formation à l’utilisation des logiciels commerciaux pour l’analyse des données.
- Collaborations et développements technologiques.
EQUIPEMENTS
CytAssist – 10x Genomics
Nécessaire au protocole Visium, il permet de transferer les sondes hybridées aux ARNs du tissu vers la lame Visium ou résident les barcodes spatiaux.
GeoMx DSP – nanoString
Permet l’analyse transcriptionnelle et/ou protéomique de régions d’interêts sélectionnées sur la base de marqueurs morphologiques.
nCounter®️ Analysis System – nanoString
Solution rapide et fiable pour l’analyse de l’ARN, l’ADN jusqu’à 800 cibles en simultané avec l’utilisation de sondes optiques barcodées.
COMET- Lunaphore
Voir plateau d’histologie (lien)
Logiciels
Loupe Browser – 10x Genomics
Logiciel de visualisation fournissant des fonctionnalités d’analyse intuitive pour explorer les données 10x Genomics (clustering supervisé et non supervisé, tSNE, UMAP, visualisation spatiale de signatures transcriptionnelles candidates, etc…).
Formation gratuite
Solutions d’analyse nanoString
Logiciels d’analyses intégrés et dédiés à l’analyse des données nanoString:
GeoMx® Data Center et nSolver™ Data Analysis Support.
Formation gratuite
TARIFS
