Plateau d’imagerie

“UNE IMAGE VAUT 1000 MOTS “

Confusius

“UNE IMAGE VAUT 1000 DONNÉES “

le CHICS

Présentation

Le plateau d’imagerie propose une infrastructure et une expertise de pointe pour répondre à vos besoins en microscopie. Nous offrons une gamme de microscopes allant du conventionnel à la microscopie confocale.

Nous proposons des services de scan de lames, des formations à l’utilisation autonome des équipements ainsi qu’à l’analyse des images. Nous favorisons également les collaborations étroites pour des analyses approfondies ou le développement d’analyses par intelligence artificielle.

Services

Le plateau d’imagerie propose :

Conseils afin d’optimiser la qualité des images de vos marquages.
Assistance et formation à l’utilisation des instruments.
Prestations de scan de lames.
Analyses et formation à l’analyse des images.
Collaborations.

Zeiss – AxioObserver.Z1

Microscope à champs large : champ clair, lumière polarisée et fluorescence

Fluorescence : 4 paramètres

DAPI*(Ex=365nm; Em=445nm)

FITC* (Ex=470nm; Em=525nm)

TRITC* (Ex=545nm; Em=605nm)

Cy5* (Ex=640nm; Em=690nm)

*ou Fluorochromes compatibles

Microscope Confocal à balayage laser

Acquisition d’image 3D en fluorescence

Fluorescence : 4 paramètres

DAPI* (Ex=365nm; Em=445nm)

FITC* (Ex=470nm; Em=525nm)

TRITC* (Ex=545nm; Em=605nm)

Cy5* (Ex=640nm; Em=690nm)

*ou Fluorochromes compatibles

Scanner Zeiss – AxioScan.Z1

Scanner de lames – Capacité 100 lames – Champ clair et fluorescence

Fluorescence: 5 paramètres

DAPI* (Ex=365nm; Em=445nm)

FITC* (Ex=470nm; Em=525nm)

TRITC* (Ex=545nm; Em=605nm)

Cy5* (Ex=640nm; Em=690nm)

Cy7* (Ex=735nm; Em=809nm)

*ou Fluorochromes compatibles

Scanner spectral Akoya – PhenoImager HT

Capacité 80 lames – Champ clair et fluorescence

Demixing et prise en charge de l’autofluorescence du tissu

Fluorescence: 7 paramètres

DAPI* (Ex=391nm; Em=453nm)

Opal480* (Ex=524nm; Em= 478nm)

Opal520* (Ex=486nm; Em=532nm)

Opal570* (Ex=538nm; Em=571nm)

Opal620* (Ex=590nm; Em=633nm)

Opal690* (Ex=699nm; Em=709nm)

Opal780* (Ex=735nm; Em=832nm)

*ou Fluorochromes compatibles

Logiciels

Logiciel avancé d’analyse d’image (qualitatives, quantitatives, supervisée et non supervisée, segmentation des cellules, etc…) offrant une automatisation pour la quantification des données.

Disponible sur un poste informatique au CHICS – Formation gratuite

Visiopharm overview

ZEN est l’interface utilisateur universelle qui équipe tous les systèmes d’imagerie de ZEISS pour capturer et traiter les images.

QuPath est un logiciel open-source d’analyse d’images permettant la détection, la segmentation et la quantification des cellules et des tissus dans des images histologiques.

Formation gratuite

Lien pour télécharger QuPath